Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb1Q9JIF7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms