Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms