Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhojQ9ER71 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms