Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms