Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms