Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne8Q9DC53 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms