Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms