Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms