Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms