Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco2Q9DA21 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms