Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms