Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9H8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9H8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9H8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D9H8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms