Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc70Q9D9B0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc70Q9D9B0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms