Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms