Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hm13Q9D8V0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hm13Q9D8V0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms