Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms