Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms