Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Echdc3Q9D7J9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Echdc3Q9D7J9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Echdc3Q9D7J9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Echdc3Q9D7J9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Echdc3Q9D7J9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Echdc3Q9D7J9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Echdc3Q9D7J9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Echdc3Q9D7J9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Echdc3Q9D7J9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Echdc3Q9D7J9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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