Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc39Q9D5Y1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc39Q9D5Y1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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