Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms