Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms