Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms