Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms