Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UvssaQ9D479 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UvssaQ9D479 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms