Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms