Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933436I01RikQ9D3T1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933436I01RikQ9D3T1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933436I01RikQ9D3T1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933436I01RikQ9D3T1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933436I01RikQ9D3T1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933436I01RikQ9D3T1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933436I01RikQ9D3T1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933436I01RikQ9D3T1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933436I01RikQ9D3T1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933436I01RikQ9D3T1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933436I01RikQ9D3T1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933436I01RikQ9D3T1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933436I01RikQ9D3T1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933436I01RikQ9D3T1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms