Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc8Q9D2H8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc8Q9D2H8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc8Q9D2H8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc8Q9D2H8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc8Q9D2H8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc8Q9D2H8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc8Q9D2H8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms