Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms