Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms