Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ifitm1Q9D103 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ifitm1Q9D103 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ifitm1Q9D103 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ifitm1Q9D103 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ifitm1Q9D103 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ifitm1Q9D103 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ifitm1Q9D103 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ifitm1Q9D103 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ifitm1Q9D103 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ifitm1Q9D103 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifitm1Q9D103 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifitm1Q9D103 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms