Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms