Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms