Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Smurf1Q9CUN6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Smurf1Q9CUN6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smurf1Q9CUN6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smurf1Q9CUN6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smurf1Q9CUN6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smurf1Q9CUN6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smurf1Q9CUN6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smurf1Q9CUN6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smurf1Q9CUN6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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