Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms