Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms