Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms