Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd1Q9CR42 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd1Q9CR42 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms