Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms