Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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