Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Smim8Q9CQQ0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Smim8Q9CQQ0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smim8Q9CQQ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smim8Q9CQQ0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smim8Q9CQQ0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smim8Q9CQQ0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Smim8Q9CQQ0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Smim8Q9CQQ0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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