Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpb2Q9CQI7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms