Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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