Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQC3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQC3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQC3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms