Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms