Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp26Q99MX1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp26Q99MX1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp26Q99MX1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp26Q99MX1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp26Q99MX1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp26Q99MX1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp26Q99MX1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp26Q99MX1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp26Q99MX1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp26Q99MX1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp26Q99MX1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp26Q99MX1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp26Q99MX1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms