Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms