Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms