Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms