Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin3Q99JB8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms