Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf144aQ925F3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms